Наталья Трунова — вице-президент, руководитель направления «Пространственное развитие» Фонда «Центр стратегических разработок»
2002 — 2009 г. — ЦСР «Северо-Запад», последняя должность — руководитель проектного направления.
2010 — 2012 г. — председатель Государственного комитета по туризму, инвестициям и пространственному развитию Псковской области.
2013 — октябрь 2014 г. — директор ГКУ «Агентство экономического развития Ленинградской области».
2014 — 2015 г. — исполнительный/генеральный директор ООО «Институт «Ленгипрогор».
С 2017 года занимает должность вице-президента Фонда «Центр стратегических разработок» — руководитель направления «пространственное развитие».